クロＥ６５４－１０１（クロＥ６５４－１０１：青い梅氏撮影）
１号車となる制御車です。定員は２２名、床下に非電化区間入線時に車内電源用となるディーゼル発電機が搭載されています。乗降用扉が無いのが特徴です。
モロＥ６５５－１０１（モロＥ６５５－１０１：青い梅氏撮影）
２号車になるパンタグラフ付中間電動車です。定員は３２名、主回路機器を床下に搭載している他、予備パンタグラフも搭載しています。
モロＥ６５４－１０１（モロＥ６５４－１０１：青い梅氏撮影）
３号車となる中間電動車です。定員は９名。ＳＩＶ、電動空気圧縮機を搭載しています。座席は他車が布張りに対し、本革張りとなっています。この車輛は個室のＶＩＰ室で構成されており、ＶＩＰ専用の車椅子対応トイレ、ギャレー（厨房）が設置されています。
モロＥ６５５－２０１（モロＥ６５５－２０１：青い梅氏撮影）
４号車となるパンタグラフ付中間電動車です。定員は２７名、モロＥ６５５－１０１と同じ機器を搭載しています。車内が少し異なり、ギャレーが設置されています。
クモロＥ６５４－１０１（クモロＥ６５４－１０１：青い梅氏撮影）
５号車に位置する制御電動車です。定員は１７名、車椅子対応トイレ、多目的室の設備があります。ＳＩＶ、電動空気圧縮機を搭載しています。写真は連結器が見えていますが、お召し列車運転時などでは連結器を収納します。
Ｅ６５５－１（Ｅ６５５－１：ｔｕｂｏフォトオフィス様撮影）
天皇、国賓が利用される時のみ連結される特別車輛です。特別室、休憩室、控室で構成されています。中間付随車で、用途などを示す「サロ」や「サハ」といった記号は付きません。Ｅ６５５系のほか、Ｅ２５７系、Ｅ６５３系などと連結をする事も可能となっています。