クモハ７８６－１～（クモハ７８６－５）
博多・小倉方のパンタグラフ付制御電動車です。主制御装置、補助電源装置を搭載しています。写真は特急「つばめ」号時代のものです。
クモロ７８７－１～（クモロ７８７－１）
新八代・熊本方の制御電動車です。主制御器と発電ブレーキ用抵抗器を搭載しています。１＋２列の一般グリーン席のほか、トップキャビン（セミ個室）、サロンコンパートメント（４人用個室）があります。現在はトップキャビンが廃止され、３列のデラックスシートに変更しています。
クハ７８７－１～（クハ７８７－３）
４両編成が登場する際に新製された特急「有明」号用の制御車です。「つばめ」号用と区別するため、ロゴが入れられました。客室仕切りは８８３系と同じものが使われています。
クハ７８７形式１００番代（クハ７８７－１０８）
短編成化に伴い、不足する制御車を補うためサハ７８７－１０１～を先頭車化改造したグループです。車番は種車のものを継承しています。
クロハ７８６－１～（クロハ７８６－６）
特急「有明」号用の制御車です。グリーン室と普通室の合造車で、車端部に喫煙室、トイレ、洗面所の設備があります。
モハ７８６－１～（モハ７８６－５）
パンタグラフ付中間電動車です。客席の他に簡易ベットを備える多目的室、身障者対応トイレ、自動販売機の設備があります。
モハ７８６－１０１～（モハ７８６－１０５）
クモロ７８７形式とユニットを組むパンタグラフ付中間電動車です。補助電源装置を搭載しています。車内の構成は０番代と同じです。
モハ７８６－２０１～（モハ７８６－２０１）
モハ７８６－１～の身障者対応設備を改良したグループです。外観では乗降扉幅が拡大されています。
モハ７８７－１～（モハ７８７－５）
主制御器と電動空気圧縮機を搭載する中間電動車です。トイレ、洗面所の設備があります。
サハ７８７－１～（サハ７８７－７）
中間付随車です。中央部の窓のない部分はロッカーになっています。トイレ、洗面所の設備があります。
サハ７８７－１０１～（サハ７８７－１０１）
０番代と同じ、普通席の中間付随車です。トイレと、洗面所がないため同系では最大の定員数となっています。
サハ７８７－２０１～（サハ７８７－２０２）
サハシ７８７形式を普通車に改造したグループです。ビュッフェ車時代の屋根がそのまま残されており、外観の特徴となっています。ビュッフェ、４人用コンパートメントを２＋２列の普通席に改造しました。また、ビュッフェ部分の窓も拡大されています。
サハシ７８７－１～（サハシ７８７－５）
４人用コンパートメントとビュッフェからなる中間付随車です。ＪＲ新製電車では唯一の食堂車でした。平成１４年に普通車化改造を全車受け、形式消滅しています。登場からわずか１０年という短い生涯でした。